English (United Kingdom)Croatian(HR)

Main Menu

Newsflash

The Agreement among participating institutions (Founding Contract) has been signed (see the link). All other legal documents about this PhD programme will be based on this Agreement.

 

Qualification awarded in recognition of completion of this PhD study has been recently described in the Croatian depository of legal acts (official gazette) Narodne Novine so to be in full accord with our Founding Contract. We used yellow underlining to outline relevant parts of text here.

 

 

 

STRUKTURA I ORGANIZACIJA DOKTORSKOG PROGRAMA

Pažnja, open in a new window. PDFIspis

STRUKTURA I ORGANIZACIJA DOKTORSKOG PROGRAMA


Studij u punom radnom vremenu završava nakon najviše četiri godine studija. Studij s dijelom radnog vremena završava nakon najviše šest godina studija. Samo u iznimnim slučajevima Vijeće studija odobrit će studentima trajanje studiranje duže od četiri godine, ali ne duže nego što to zakon dozvoljava. Na primjer za studente koji ne ulaze sa svim potrebnim predznanjem, Vijeće studija može odlučiti da se vrijeme potrebno da bi se prošlo kroz pripremne (razlikovne) kolegije ne računa u rok od četiri godine.
Velika većina ponuđenih predmeta izravno vodi prema istraživanjima na doktorskom studiju biofizike. Postoje ipak i neki opći obvezni i izborni predmeti u kojima studenti mogu naučiti standardne moderne eksperimentalne tehnike u biofizici, biomedicini i molekularnoj biologiji. Izbor ponuđenih predmeta napravljen je i s obzirom na međunarodni ugled kolega koji nude te predmete i s obzirom na relevantnost za biofiziku. Naš je cilj bio ponuditi predmete, čiji nositelji imaju dobro razvijenu međunarodnu suradnju, ambiciozni istraživački projekt i jednu ili više istraživačkih tema pogodnih za temu doktorskog rada. Drugim riječima svaki naš nositelj obveznog ili izbornog kolegija može biti i mentor za izradu doktorskog rada. Shodno tome, od svih voditelja predmeta, bilo da se radi o obveznim ili izbornim predmetima, zatražili smo da ponude najmanje jednu istraživačku temu koja bi mogla voditi prema kvalitetnom doktoratu. Lista voditelja predmeta i istraživačkih tema koje su ponudili stavit će se na raspolaganje studentima odmah na početku studija, kako bi im olakšali odluku kojeg istraživača žele izabrati kao mentora. U tome će bitnu ulogu imati i «Burza mentora» radni skup tijekom kojeg ćemo identificirati komplementarna istraživanja kojima ćemo poticati rad studenata pod optimalnim nadzorom mentora i Vijeća studija. U poglavlju 4.3 lista je onih nastavnika/istraživača koji su već priložili naslove mogućih tema za izradu doktorskog rada koje bi oni mogli voditi. Vijeće studija imat će obvezu potvrditi svaku temu i odgovarajuće mentore za svaku generaciju studenata.
Svi ponuđeni predmeti mogu se prirodno grupirati u tri skupine (vidi slijedeće Poglavlje 3.2 – tablicu ponuđenih predmeta):

  1. Osnove biofizike, fizike i biologije. To su predmeti koje nude A. Bilušić, i kolege s IRB-a (G. Baranović, B. Rakvin, V. Svetličić, D. Vikić-Topić, I. Weber), D. Juretić, N. Krstulović, H. Lutz, S. Marčelja, R. Podgornik, D. Ražem, Silvia Tomić, I. Weber i M. Tolić-Norrelykke, P. Županović.
  2. Modeliranje i strukturna bioinformnatika. To su predmeti koje nude M. Brumen, R. Dewar, D. Juretić, B. Lučić, A. Graovac, V. Paar, F. Sokolić, Sanja Tomić i B. Žagrović.
  3. Biofizika i biomedicina.. To su predmeti koje nude K. Pavelić i suradnici s IRB-a (S. Kraljević Pavelić, M. Sedić, K. Hock, M. Baus Lončar), A. Ambriović-Ristov, D. Eterović, M. Dželalija, Z. Đogaš, G. Kilić, V. Parpura, S. Supek, J. Terzić, M. Vrtar.

 



POPIS OBVEZNIH I IZBORNIH PREDMETA


I. semestar: obvezni predmeti

Kod

Naziv predmeta

Nastava * P+S+V+L

ECTS

PMP303

Modeliranje biomakromolekula i njihovih kompleksa
(Sanja Tomić, Ante Graovac)

20+4+8+4

6

PMP302

Biofizika stanice I (I. Weber, I. M. Tolić-Norrelykke, S. Marčelja, D. Juretić)

24+4+0+0

6

PMP304

Bioinformatika, biofizika i bioenergetika membranskih protein (D. Juretić, B. Žagrović)

20+4+6+4

6

 

Izborni predmet I**

 

6

 

Izborni predmet II i/ ili istraživački rad studenata***

 

6

UKUPNO:

 

30

*P = predavanja, S = seminar,V = vježbe,L = laboratorijske vježbe. Za razliku od auditornih vježbi (V) laboratorijske vježbe (L) su praktičan rad s instrumentima u laboratoriju ili pak modeliranje/simulacije pomoću računala.
**Samo studenti s izvrsnim predznanjem mogu na osnovu dogovora s Vijećem studija i na osnovu preporuke već odabranog mentora uzeti istraživački rad kao Izborni predmet I.
*** U dogovoru s Vijećem studija i profesorima savjetnicima student može (ali ne mora) uzeti još jedan izborni kolegij umjesto opsežnijeg istraživačkog rada u prvom semestru. Taj kolegij može također biti iz ponude izbornih predmeta za naš studij ili iz ponude predmeta za neki drugi srodni doktorski studij. Vijeće studija može studentu priznati ECTS kredite za praktično obrazovanje iz nekog područja biofizike, biologije sustava, genomike, proteomike ili strukturne bioinformatike, koje je student postigao u nekom renomiranom laboratoriju. Također, taj kolegij može biti razlikovni kolegij potreban studentu da bi popunio praznine u temeljnim znanjima (vidi Dodatak I)

 

I. semestar: izborni predmeti

Kod

Naziv predmeta

Nastava * P+S+V+L

ECTS

PMP307

Struktura i dinamika molekula, spektroskopija i simulacije (F. Sokolić)

20+0+10+5

6

PMP308

Neravnotežna termodinamika (P. Županović)

30+0+15+0

6

PMP309

Primjena zračenja u radioterapijskoj onkologiji (M. Vrtar)

20+15+0+0

6

PMP310

Fizičko-kemijski temelji radiobiologije (D. Ražem)

24+6+6+0

6

PMP311

Multifaktorske statističke metode u biomedicini (D. Eterović)

12+0+0+16

6

PMP312

Fizika DNK, kromatina i virusa (R. Podgornik)

20+0+20+0

6

PMP313

Molekularna genetika (J. Terzić)

24+10+0+12

6

PMP314

Mikroorganizmi i okoliš (N. Krstulović)

15+0+0+30

6

PMP328

Modeli i metode u strukturnoj bioinformatici (B. Lučić)

15+5+15+0

6

PMP316

Metode u molekularnoj biologiji i medicini (A. Ambriović-Ristov)

0+0+0+30

6

 

Praktikum iz molekularne biologije

 

6

 

Osnove i principi masene spektroskopije

 

6

 

Primjene masene spektroskopije u biologiji i medicine

 

6

 

Istraživački rad studenata

0+6+0+20

6

* P = predavanja, S = seminar, V = vježbe, L = laboratorijske vježbe.

 


II. semestar: obvezni predmeti

Kod

Naziv predmeta

Nastava * P+S+V+L

ECTS

PMP301

Eksperimentalne metode fizike u biofizici
(G. Baranović, B. Rakvin, V. Svetličić, D. Vikić-Topić, I. Weber, B. Žagrović)

26+4+0+30

12

 

Izborni predmet III**

 

6

 

Izborni predmet IV i/ili istraživački rad studenata***

 

6 do12

 

Sudjelovanje na međunarodnoj ljetnoj školi ****

 

do     6

UKUPNO:

 

30

*P = predavanja, S = seminar, V = vježbe, L = laboratorijske vježbe.
**Samo studenti s izvrsnim predznanjem mogu na osnovu dogovora s Vijećem studija i na osnovu preporuke već odabranog mentora uzeti istraživački rad kao Izborni predmet III.
***U dogovoru s Vijećem studija i profesorima savjetnicima student može (ali ne mora) uzeti još jedan izborni kolegij umjesto opsežnijeg istraživačkog rada u drugom semestru. Taj kolegij može također biti iz ponude izbornih predmeta za naš studij ili iz ponude predmeta za neki drugi srodni doktorski studij. Vijeće studija može studentu priznati ECTS kredite za praktično obrazovanje iz nekog područja biofizike, biologije sustava, genomike, proteomike ili strukturne bioinformatike koje je student postigao u nekom renomiranom laboratoriju. Tođer, taj kolegij može biti jedan ili dva razlikovna kolegija potrebna studentu da bi popunio praznine u temeljnim znanjima (vidi Dodatak I). Studenti s većim prazninama u prethodnom obrazovanju neće moći pohađati ljetnu školu u drugom semestru nego će se koncentrirati na polaganje do 12 ECTS kredita razlikovnih kolegija u tom semestru.
****Do 6 ECTS za međunarodnu ljetnu školu uzima u obzir da je maksimalni broj ECTS kredita po semestru 30. Ta promjena (u odnosu na “do 4 ECTS”) također ne mijenja odnos obaveznih i izbornih kolegija, jer ostaje broj od 12 ECTS kredita za obavezne kolegije u II semestru.

 

II. semestar: izborni predmeti

Kod

Naziv predmeta

Nastava * P+S+V+L

ECTS

PMP306

Repeticije višeg reda u humanom genomu (V. Paar)

20+5+5+5

6

PMP317

Teorija i eksperiment u izučavanju procesa smatanja proteina (B. Žagrović)

20+6+0+10

6

PMP318

Primjene principa maksimalne proizvodnje entropije u fizici i biologiji  (R. Dewar, D. Juretić, S. Marčelja, P. Županović, ..)

12+4+0+4

6

PMP319

Fizika medicinske dijagnostike (D. Eterović)

7+8+0+15

6

PMP320

Biofizika stanice II (G. Kilić)

20+0+10+0

6

PMP321

Matematičko modeliranje bioloških procesa; Odabrane teme (M. Brumen)

10+5+10+10

         6

PMP322

Struktura i interakcije u polielektrolitima: osnove teorije i eksperimentalna provjera (Silvia Tomić i T. Vuletić)

10+5+0+15

6

PMP323

Signalizacija u mozgu (V. Parpura)

10+5+0+0

4

PMP324

Biofizikalni i biomedicinski temelji oksidacijskog stresa (N. Žarković)

6+4+0+0

2

PMP325

Temelji neuroznanosti (Z. Đogaš)

10+15+0+15

6

PMP326

Neurodinamika (S. Supek)

15+5+0+10

6

PMP327

Nanofizika i nanotehnologija (H. Lutz)

20+10+10+0

6

PMP328

Modeli i metode u strukturnoj bioinformatici (B. Lučić)(isti izborni kolegij ponuđen je i u prvom semestru)

15+5+15+0

6

PMP329

Biomehanika (M. Dželalija)

20+0+0+10

6

 

Strukturni, elektronski i dinamički aspekti biofizikalnih procesa

 

6

 

Planiranje i pisanje znanstvenog rada

 

6

 

Istraživački rad studenata

0+6+0+20

6

* P = predavanja, S = seminar, V = vježbe, L = laboratorijske vježbe.

 

III. semestar: obvezni predmeti

Kod

Naziv predmeta

Nastava * P+S+V+L

ECTS

 

Istraživački rad iz biofizike  (prema predloženim temama za doktorska istraživanja u biofizici – vidi Poglavlje 4.3)

 

23

PMP305

Osnove sistemske biomedicine (K. Pavelić, S. Kraljević Pavelić, M. Sedić, K. Hock, M. Baus Lončar)

10+4+0+0

3

PMP328

 
Interdisciplinarni seminari i tečajevi iz bio-znanosti 
(Ugledni međunarodni predavači, vidi pobliže u opisu kolegija).

 (organizatori S. Marčelja, D. Juretić, V. Bonačić - Koutecký))

0+20+0+0

4

UKUPNO:

 

30

* P = predavanja, S = seminar, V = vježbe, L = laboratorijske vježbe.

 

IV. semestar: obvezni predmeti

Kod

Naziv predmeta

Nastava *
P+S+V+L

ECTS

 

Istraživački rad iz biofizike i studentski seminari (prema predloženim temama za doktorska istraživanja u biofizici – vidi Poglavlje 4.3). Seminari studenta o istraživačkom radu na temama koje student izabere u dogovoru s mentorom.**

 

26

 

Interdisciplinarni seminari i tečajevi iz bio-znanosti (Ugledni međunarodni predavači, vidi pobliže u opisu kolegija) (organizatori S. Marčelja, D. Juretić, V. Bonačić - Koutecký)

0+20+0+0

4

UKUPNO:

 

30

* P = predavanja, S = seminar, V = vježbe, L = laboratorijske vježbe.
** Do 4 ECTS mogu se dobiti i u ovom semestru za aktivno sudjelovanje (s posterom ili predavanjem) u nekoj međunarodnoj ljetnoj školi ili konferenciji. Tada dolazi do odgovarajućeg smanjenja broja ECTS kredita za istraživački rad i seminare iz biofizike.

 


V. semestar: obvezni predmeti

Kod

Naziv predmeta

Nastava *
P+S+V+L

ECTS

 

Istraživački rad i rad na izradi doktorata u kojemu studenta vodi izabrani mentor

 

27

 

Seminar studenta o istraživačkom radu studenta i prvi seminar o predloženoj temi doktorske disertacije                                              

 

3

UKUPNO:

 

30

* P = predavanja, S = seminar, V = vježbe, L = laboratorijske vježbe.

 

VI. semestar: obvezni predmeti

Kod

Naziv predmeta

Nastava *
P+S+V+L

ECTS

 

Istraživački rad i rad na izradi doktorata u kojemu studenta vodi izabrani mentor

 

27

 

Dva seminara studenta o rezultatima istraživačkog rada na doktorskoj tezi studenta i obrana doktorske disertacije.                         

 

3

UKUPNO:

 

30

* P = predavanja, S = seminar, V = vježbe, L = laboratorijske vježbe.